现阶段，对树化石的建立原始缘故有很大矛盾。
一 、就是说树化石是由于火山喷涌后，炽热溶岩将花草树木瞬间淹没，在没有氧气的情形下，木质纤维并没有在溶岩里被点燃炭化，反而是较为完整地保存了出来。后又由于地质变化，出现了地球内部坍塌或是上升，将裹着花草树木的矽卡岩掩埋地底，被地下的浓度较高的二氧化硅溶液泡浸，水里的二氧化硅跟木质纤维产生置换反应，使松软的木质纤维慢慢变为坚硬的二氧化硅石制，再后来木化石在长期高压低温的环境中，慢慢玉化，构成了现今隐质晶体或是蛋白晶体。
二、就是说现今木化石是由于地球上冰河挪动，大面积冰河驱使细沙，将花草树木埋藏，也是在低温高压的情形下，木质纤维与溶液里的二氧化硅产生置换反应，所形成的动物化石。后边的全过程跟第一个观点一致，仅仅前边的成因不一样，一个说是火山所造成的，一个说是冰河挪动所造成的。
本人的树化石收藏品较多，大一点的有一块石头达两三多吨，小一点几十厘米。许多树化石全是敝人自身去现场挖回来的。我发现了的树化石初始储存当场主要有两种，在其中，最多见的一种就是在灰绿色的火山岩浆岩中发现的树化石。这类树化石完全被火山岩浆岩裹着，取出来的时候很困难，这类树化石外型储存十分完好无损，尤其是树根储存完好无损，但由于获得很困难，很难保证整棵树的完好性。有一些树化石在挖掘过程中发现有烧黑而且炭化的现象，表明被火山淹没时还是多少有些O2在其中的
上边的这两块都是在火山岩浆岩中发现的树化石，能够明显看到树根详细，花草树木纹理详细保存下来的。材料归属于隐质晶体和蛋白质晶体，玉化的很好。
另一种状况是在古河床细沙地基沉降带里发现的树化石，这类地基沉降带中含有大量鲜红色或是纯白色的火山灰。这样的情况下的树化石储存比不上上一种，树根大部分没了，动物化石实质也比较松散，而且这种树化石玉化的也不好，石能力很强。
这类是在古河道地基沉降带中发现的树化石。树根大部分没了，材料石性比较厉害，基本上没有玉化。
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